Thorshøjgård har ikke en intern skole, men hvis der er behov for det, så er det muligt at skræddersy et særligt tilrettelagt forløb for elever, der har behov for det i forhold til 9.-10. klasse. Undervisning på Thorshøjgårds skole gennemføres efter §34, Lov om Friskoler og Private Grundskoler. Niveauet ligger fra indskolingsniveau til 9. klasses niveau og det er muligt at gå til afsluttende prøve i dansk, matematik og engelsk (FP9).
Lærerne på Thorshøjgård har omfattende erfaring med at undervise elever, som ikke har gået i skole længe, som har oplevet nederlag i forbindelse med deres skolegang eller som har behov for en kombination mellem boglig læring og praktiske forløb med masser af plads til bevægelse og læring i helt fleksible rammer.
Skoleåret er inddelt i moduler af 2-5 ugers varighed, så eleverne altid ved, hvilket overordnet fagligt tema, de skal arbejde med – og hvornår.